Відсутність реєстрації або несвоєчасна реєстрація податкових накладних в Єдиному реєстрі податкових накладних призводить до накладення на платників податків штрафних санкцій. 

Велика Палата Верховного суду вказала на те, що позовна вимога покупця про зобовʼязання продавця здійснити реєстрацію податкових накладних не підлягає розгляду в суді жодної юрисдикції.